A trama se passa um século antes do evento principal, quando Qui-Gon Jinn (Liam Neeson) e Obi Wan Kenobi (Ewan McGregor) encontraram Anakin Skywalker (Jake Lloyd). É nesse período em que a República Galáctica coexistia em harmonia com a Ordem Jedi, sem a interferência do Império. Entretanto, uma série de assassinatos contra jedi desestabiliza a união. Sol (Jung-jae), um proeminente mestre jedi, investiga o caso ao lado da ex-padawan Osha (Stenberg) para descobrir o que está por trás desses crimes misteriosos. No caminho, eles se deparam com forças mais sinistras do que esperavam, que envolvem segredos e potências do lado negro da força.
